Bonjour à tous,
Je n'utilise Excel qu'avec les fonctions statistiques classiques incluent
dans le logiciel. Cependant je me suis dit qu'il était peut-être possible
d'utiliser le tableur pour la biologie moléculaire directement avec les
petites séquences (< à 100 caractères ou bases) entrées dans une cellule.
D'habitude j'utilise les petits logiciels gratuits, mais avec l'augmentation
du nombre de séquences et le besoin de classer, distribuer et ranger en
sécurité les données, l'utilisation d'excel me semble incontournable
maintenant.
Les 4 bases sont A, T, G et C.
Le calcul de température de fusion (Tm) que j'aimerais faire s'appuie sur la
formule suivante:
Il me faut donc différencier les A & T des G & C pour les compter et
calculer le % de GC dans la séquence et calculer le nombre total de
caractères (sans les espaces!) dans la cellule qui contient ma séquence pour
calculer L qui correspond à la longeur dans la formule...
et ça c'est au-dessus de mes compétences;-)
Pouvez-vous m'aider à écrire cette fonction dans excel ou m'indiquer un
endroit ou trouver l'information? Je pense que cela aidera aussi d'autres
chercheurs.
En vous remerciant par avance
Salutations distinguées
Marc
Si tu veux plus, il faudra que tu donne un peu plus de détail sur l'organisation de ta feuille.
j-p
JpPradier
"Delasouris" a écrit dans le message de news:
Merci J-P ! Je vais tenter de mettre en pratique ta solution. Qu'entends-tu par l'organisation de la feuille?
Je veux dire comment sont placées les séquences dans la feuille, si il y a des espaces... Par exemple si dans ta séquence, il n'y a pas autant de G que de C, tu calcules comment ? Remarque, c'est peut-etre impossible, j'y connais rien aux séquences de molécules ;-))
j-p
"Delasouris" <Delasouris@discussions.microsoft.com> a écrit dans le message de news:
2BCE5939-CE8C-4CC3-8C73-4C6496339DB2@microsoft.com...
Merci J-P !
Je vais tenter de mettre en pratique ta solution.
Qu'entends-tu par l'organisation de la feuille?
Je veux dire comment sont placées les séquences dans la feuille, si il y a des espaces...
Par exemple si dans ta séquence, il n'y a pas autant de G que de C, tu calcules comment ?
Remarque, c'est peut-etre impossible, j'y connais rien aux séquences de molécules ;-))
Merci J-P ! Je vais tenter de mettre en pratique ta solution. Qu'entends-tu par l'organisation de la feuille?
Je veux dire comment sont placées les séquences dans la feuille, si il y a des espaces... Par exemple si dans ta séquence, il n'y a pas autant de G que de C, tu calcules comment ? Remarque, c'est peut-etre impossible, j'y connais rien aux séquences de molécules ;-))
j-p
Delasouris
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui peut être intéressant pour discerner deux zones de calcul dans la séquence (Tm1 et Tm2). _________________Tm2______________________________ GAATTCGATACCATAGACATTGGCA ATATTATTTTTTATATTAT
----------Tm1--------------- Mais je pense faire plus simple en recopiant la partie Tm1 de la séquence dans la cellule voisine. J'espère que l'attribution de couleurs ou autres variables à l'aspect des lettres ne sera pas un handicap, ni l'absence d'une des lettres dans la séquence, cela arrive souvent. Encore merci Marc
Bonjour Marc
Pour la longueur de la séquence ( placée en A1 ) sans les espaces :
Si tu veux plus, il faudra que tu donne un peu plus de détail sur l'organisation de ta feuille.
j-p
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il
faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui
peut être intéressant pour discerner deux zones de calcul dans la séquence
(Tm1 et Tm2).
_________________Tm2______________________________
GAATTCGATACCATAGACATTGGCA ATATTATTTTTTATATTAT
----------Tm1---------------
Mais je pense faire plus simple en recopiant la partie Tm1 de la séquence
dans la cellule voisine. J'espère que l'attribution de couleurs ou autres
variables à l'aspect des lettres ne sera pas un handicap, ni l'absence d'une
des lettres dans la séquence, cela arrive souvent.
Encore merci
Marc
Bonjour Marc
Pour la longueur de la séquence ( placée en A1 ) sans les espaces :
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui peut être intéressant pour discerner deux zones de calcul dans la séquence (Tm1 et Tm2). _________________Tm2______________________________ GAATTCGATACCATAGACATTGGCA ATATTATTTTTTATATTAT
----------Tm1--------------- Mais je pense faire plus simple en recopiant la partie Tm1 de la séquence dans la cellule voisine. J'espère que l'attribution de couleurs ou autres variables à l'aspect des lettres ne sera pas un handicap, ni l'absence d'une des lettres dans la séquence, cela arrive souvent. Encore merci Marc
Bonjour Marc
Pour la longueur de la séquence ( placée en A1 ) sans les espaces :
Si tu veux plus, il faudra que tu donne un peu plus de détail sur l'organisation de ta feuille.
j-p
JpPradier
"Delasouris" a écrit dans le message de news:
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui
Ah ! tu vois que tu ne dis pas tout ;-) La couleur ou le format ( Gras-Italique ....) n'influe pas sur le résultat, mais la casse oui. Pour s'en affranchir, on peut utiliser Majuscule(A1) qui passe tout en majuscule par exemple et l'intégrer à la formule :
"Delasouris" <Delasouris@discussions.microsoft.com> a écrit dans le message de news:
39A77E7E-6DB6-4EBB-8FEA-BC3E1AFEFF90@microsoft.com...
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il
faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui
Ah ! tu vois que tu ne dis pas tout ;-)
La couleur ou le format ( Gras-Italique ....) n'influe pas sur le résultat, mais la casse
oui. Pour s'en affranchir, on peut utiliser Majuscule(A1) qui passe tout en majuscule par
exemple et l'intégrer à la formule :
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui
Ah ! tu vois que tu ne dis pas tout ;-) La couleur ou le format ( Gras-Italique ....) n'influe pas sur le résultat, mais la casse oui. Pour s'en affranchir, on peut utiliser Majuscule(A1) qui passe tout en majuscule par exemple et l'intégrer à la formule :
Merci encore JP, c'est génial, finalement j'utilise la différence de casse et c'est très pratique. Si j'avais su que c'était possible avant!!! Je vais avoir pas mal de saisie à faire (copier/coller). Il me faut juste trouver le moyen simple de transformer des majuscules clavier en minuscules dans word ou excel au choix. Une dernière question, la copie incrémentée des formules complexes ne semble pas fonctionner... par exemple : =NBCAR($A$1)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$1;"G";"");"C";""))+C1 donne =NBCAR($A$1)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$1;"G";"");"C";""))+C2 au lieu de =NBCAR($A$2)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$2;"G";"");"C";""))+C2
Faut-il reécrire chaque ligne? Encore merci pour cet outil tout simple mais si précieux! Marc
"Delasouris" a écrit dans le message de news:
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui
Ah ! tu vois que tu ne dis pas tout ;-) La couleur ou le format ( Gras-Italique ....) n'influe pas sur le résultat, mais la casse oui. Pour s'en affranchir, on peut utiliser Majuscule(A1) qui passe tout en majuscule par exemple et l'intégrer à la formule :
Merci encore JP, c'est génial, finalement j'utilise la différence de casse et
c'est très pratique. Si j'avais su que c'était possible avant!!! Je vais
avoir pas mal de saisie à faire (copier/coller). Il me faut juste trouver le
moyen simple de transformer des majuscules clavier en minuscules dans word ou
excel au choix.
Une dernière question, la copie incrémentée des formules complexes ne semble
pas fonctionner... par exemple :
=NBCAR($A$1)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$1;"G";"");"C";""))+C1
donne
=NBCAR($A$1)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$1;"G";"");"C";""))+C2
au lieu de
=NBCAR($A$2)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$2;"G";"");"C";""))+C2
Faut-il reécrire chaque ligne?
Encore merci pour cet outil tout simple mais si précieux!
Marc
"Delasouris" <Delasouris@discussions.microsoft.com> a écrit dans le message de news:
39A77E7E-6DB6-4EBB-8FEA-BC3E1AFEFF90@microsoft.com...
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il
faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui
Ah ! tu vois que tu ne dis pas tout ;-)
La couleur ou le format ( Gras-Italique ....) n'influe pas sur le résultat, mais la casse
oui. Pour s'en affranchir, on peut utiliser Majuscule(A1) qui passe tout en majuscule par
exemple et l'intégrer à la formule :
Merci encore JP, c'est génial, finalement j'utilise la différence de casse et c'est très pratique. Si j'avais su que c'était possible avant!!! Je vais avoir pas mal de saisie à faire (copier/coller). Il me faut juste trouver le moyen simple de transformer des majuscules clavier en minuscules dans word ou excel au choix. Une dernière question, la copie incrémentée des formules complexes ne semble pas fonctionner... par exemple : =NBCAR($A$1)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$1;"G";"");"C";""))+C1 donne =NBCAR($A$1)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$1;"G";"");"C";""))+C2 au lieu de =NBCAR($A$2)-NBCAR(SUBSTITUE(SUBSTITUE($A$2;"G";"");"C";""))+C2
Faut-il reécrire chaque ligne? Encore merci pour cet outil tout simple mais si précieux! Marc
"Delasouris" a écrit dans le message de news:
Je viens de tester la formule... ça marche partiellement. Il semble qu'il faille que les lettres soient en majuscule pour discerner AT de GC ! Ce qui
Ah ! tu vois que tu ne dis pas tout ;-) La couleur ou le format ( Gras-Italique ....) n'influe pas sur le résultat, mais la casse oui. Pour s'en affranchir, on peut utiliser Majuscule(A1) qui passe tout en majuscule par exemple et l'intégrer à la formule :
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative : tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en colonne ou carrement A1 si c'est les deux. Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut passer par une petite macro.
j-p
Bonjour Marc
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative :
tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en
colonne ou carrement A1 si c'est les deux.
Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut
passer par une petite macro.
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative : tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en colonne ou carrement A1 si c'est les deux. Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut passer par une petite macro.
j-p
Delasouris
Alors là merci de tout coeur JP... ça "fonctionne" ;-) super bien... et tu m'as permis de comprendre en peu de temps des petits trucs d'écriture de fonctions dans excel. Je pense que de nombreux étudiants et chercheurs utiliseront cette fonction en la recopiant dans leurs tableurs. Je vais tenter de la transformer en Fonction "Tm" et la faire apparaitre dans le menu déroulant comme pour les sommes etc. En fait c'est très amusant de sortir de son domaine de compétences au travers de l'aide que tu m'as donnée. Encore merci Marc
"JpPradier" wrote:
Bonjour Marc
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative : tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en colonne ou carrement A1 si c'est les deux. Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut passer par une petite macro.
j-p
Alors là merci de tout coeur JP... ça "fonctionne" ;-) super bien... et tu
m'as permis de comprendre en peu de temps des petits trucs d'écriture de
fonctions dans excel. Je pense que de nombreux étudiants et chercheurs
utiliseront cette fonction en la recopiant dans leurs tableurs. Je vais
tenter de la transformer en Fonction "Tm" et la faire apparaitre dans le menu
déroulant comme pour les sommes etc. En fait c'est très amusant de sortir de
son domaine de compétences au travers de l'aide que tu m'as donnée.
Encore merci
Marc
"JpPradier" wrote:
Bonjour Marc
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative :
tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en
colonne ou carrement A1 si c'est les deux.
Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut
passer par une petite macro.
Alors là merci de tout coeur JP... ça "fonctionne" ;-) super bien... et tu m'as permis de comprendre en peu de temps des petits trucs d'écriture de fonctions dans excel. Je pense que de nombreux étudiants et chercheurs utiliseront cette fonction en la recopiant dans leurs tableurs. Je vais tenter de la transformer en Fonction "Tm" et la faire apparaitre dans le menu déroulant comme pour les sommes etc. En fait c'est très amusant de sortir de son domaine de compétences au travers de l'aide que tu m'as donnée. Encore merci Marc
"JpPradier" wrote:
Bonjour Marc
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative : tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en colonne ou carrement A1 si c'est les deux. Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut passer par une petite macro.
j-p
JpPradier
:-) Bienvenue ! et n'hésite pas à revenir.
j-p
"Delasouris" a écrit dans le message de news:
Alors là merci de tout coeur JP... ça "fonctionne" ;-) super bien... et tu m'as permis de comprendre en peu de temps des petits trucs d'écriture de fonctions dans excel. Je pense que de nombreux étudiants et chercheurs utiliseront cette fonction en la recopiant dans leurs tableurs. Je vais tenter de la transformer en Fonction "Tm" et la faire apparaitre dans le menu déroulant comme pour les sommes etc. En fait c'est très amusant de sortir de son domaine de compétences au travers de l'aide que tu m'as donnée. Encore merci Marc
"JpPradier" wrote:
Bonjour Marc
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative :
tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en
colonne ou carrement A1 si c'est les deux. Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut passer par une petite macro.
j-p
:-) Bienvenue ! et n'hésite pas à revenir.
j-p
"Delasouris" <Delasouris@discussions.microsoft.com> a écrit dans le message de news:
4EB5AA6A-C301-4280-99CC-68D438DAB2A4@microsoft.com...
Alors là merci de tout coeur JP... ça "fonctionne" ;-) super bien... et tu
m'as permis de comprendre en peu de temps des petits trucs d'écriture de
fonctions dans excel. Je pense que de nombreux étudiants et chercheurs
utiliseront cette fonction en la recopiant dans leurs tableurs. Je vais
tenter de la transformer en Fonction "Tm" et la faire apparaitre dans le menu
déroulant comme pour les sommes etc. En fait c'est très amusant de sortir de
son domaine de compétences au travers de l'aide que tu m'as donnée.
Encore merci
Marc
"JpPradier" wrote:
Bonjour Marc
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence
relative :
tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la
recopie en
colonne ou carrement A1 si c'est les deux.
Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut
passer par une petite macro.
Alors là merci de tout coeur JP... ça "fonctionne" ;-) super bien... et tu m'as permis de comprendre en peu de temps des petits trucs d'écriture de fonctions dans excel. Je pense que de nombreux étudiants et chercheurs utiliseront cette fonction en la recopiant dans leurs tableurs. Je vais tenter de la transformer en Fonction "Tm" et la faire apparaitre dans le menu déroulant comme pour les sommes etc. En fait c'est très amusant de sortir de son domaine de compétences au travers de l'aide que tu m'as donnée. Encore merci Marc
"JpPradier" wrote:
Bonjour Marc
Pour la recopie incrémentée, il faut changer la référence absolue en référence relative :
tu remplaces $A$1 par $A1 si c'est de la recopie en ligne ou A$1 si c'est de la recopie en
colonne ou carrement A1 si c'est les deux. Pour le changement de casse, c'est possible directement dans Word. Dans Excel, il faut passer par une petite macro.
