Le réel attrait de cet épisode se concrétise dans son approche en ligne. En effet, la prise en main s'adapte parfaitement au jeu en coopération, offrant des combats en duo. Les attaques combinées à base d'alchimie formeront le coeur des combats et nécessiteront que les deux joueurs soient parfaitement coordonnés au travrers de Quick Time Events. Ainsi, il sera possible de s'adonner à des parties multijoueur jusqu'à quatre en mode ad-hoc.
FullMetal Alchemist : Brotherhood sera disponible en Europe au cours du mois de juin 2010.