Le producteur exécutif chez BioWare, Casey Hudson, a déclaré au travers de son blog IGN que Mass Effect 3 remettra en avant Shepard et ce, même si ce dernier meurt dans le second volet. Cependant, il souligne le fait qu'il ne s'agira pas forcément du héros que l'on a connu par le passé :
« Si votre Shepard meurt à la fin de Mass Effect 2, c'est la fin pour lui. Dans ce cas, vous pouvez jouer à Mass Effect 3 avec "un" Shepard - tout simplement pas "votre" Shepard. Donc, si vous vous souciez de jouer au prochain jeu avec votre personnage, assurez-vous de survivre à celui-ci ».
A priori, la mission finale de Mass Effect 2 aura deux issues, dont une fatale qui se répercutera sur le volet suivant. Pour survivre, il faut apparemment appliquer les améliorations nécessaire à Shepard. Le concept peut paraître très intéressant et laisse présager des possibilités de scénario différents pour Mass Effect 3, en important sa sauvegarde.