Les premières éditions de The Legend of Zelda : Wind Waker contenaient un disque additionnel sur lequel se trouvaient les deux opus sortis sur NES ainsi que ceux commercialisés sur Nintendo 64. Mais dans le cas d'Ocarina of Time, la Master Quest fut rajoutée, et c'était là la toute première fois que l'on pouvait y jouer. La Master Quest est en fait une version alternative d'Ocarina of Time. Tout y est identique, à l'exception des donjons dont les énigmes sont beaucoup plus difficiles que dans le jeu original.
Un journaliste de CNM (Conservative New Media) qui était présent à la Game Developers Conference 2011 nous apprend que cette Master Quest sera bien comprise dans la cartouche de The Legend of Zelda : Ocarina of Time 3D. Un argument supplémentaire pour pousser à l'achat de ce remake, après celui des graphismes améliorés par rapport à la mouture N64.
The Legend of Zelda : Ocarina of Time 3D sera disponible sur Nintendo 3DS à partir de juin prochain.