Debian @ COVID-19 Biohackathon (April 5-11, 2020)

Le
Marc Chantreux
salut tous,

je me permet de relayer cette annonce

vu qu'il y a des RFP dedans, je me permet de relayer
cette annonce:

https://lists.debian.org/debian-devel-announce/2020/03/msg00010.html

bon confinement,
marc
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S L
Le #26541776
Bonjour !
Merci, cela tombe bien, je viens de lire ceci
Folding at home : la puissance de calcul des ordinateurs mise en
commun pour lutter contre le coronavirus
https://www.lesnumeriques.com/ordinateur/foldingathome-la-puissance-de-calc ul-des-ordinateurs-mise-en-commun-pour-lutter-contre-le-coronavirus-n148701 .html
https://fr.wikipedia.org/wiki/
https://foldingathome.org/
J'installe BOINC sur toutes mes machines (tour, portable, smartphone,
tablette) depuis des années.
Article https://fr.wikipedia.org/wiki/Berkeley_Open_Infrastructure_for_Netw ork_Computing
Site officiel https://boinc.berkeley.edu/download.php
Alliance Francophone http://www.boinc-af.org/
Rosetta, orienté biologie http://boinc.bakerlab.org/rosetta/
En France il y a eu le Décrypthon de l'AFM contre la Dystrophie
Musculaire. Il est à présent inclus dans le World Community Grid
parrainé par IBM et accessible par BOINC.
Bons calculs !
Stef
Le dim. 29 mars 2020 à 16:58, Marc Chantreux
salut à tous, vu qu'il y a des RFP dedans, je me permets de relayer cette annonce:
https://lists.debian.org/debian-devel-announce/2020/03/msg00010.html
bon confinement, Marc
Basile Starynkevitch
Le #26541786
On 29/03/2020 17:57, Marc Chantreux wrote:
salut,
Folding at home : la puissance de calcul des ordinateurs mise en
commun pour lutter contre le coronavirus

sans vouloir faire mon chieur avec le changement climatique tout ça ...
en terme de traffic réseau ca représente quel volume de données moyen par jour?


Je n'en sais rien mais j'imagine que c'est peu. Les calculs de biochimie
sont intensifs en flottants. Comme la plupart des calculs de maillage en
éléments finis, ou de MonteCarlo.
Par ailleurs, en France, l'électricité (y compris celle consommée par
les infrastructures datacenter et telecom et par nos PCs Debian laissés
allumés la nuit) est majoritairement nucléaire, donc elle produit peu de
gaz à effet de serre.
--
Basile Starynkevitch - http://starynkevitch.net/Basile/
Bourg La Reine, France opinions are only mine - les opinions sont seulement miennes
yves croison
Le #26541789
Sur Rosetta les temps de calcul varie de 1H a 24H ( on peut choisir ).
Le 29/03/2020 à 18:57, Marc Chantreux a écrit :
hello,
En tant que telle, l'utilisation du réseau est bien moindre par
rapport à un job MPI sur une grappe de calculateurs. J'aurais
tendance à penser que l'énergie consommée par les transferts est
négligeable devant celle déployée pour les traitements.

bon ... 1go toutes les 10h ca me parrait acceptable et je vais te faire
confiance en l'absence d'autres chiffres.
cordialement,
marc
Fran=c3=a7ois LE GAD
Le #26541840
Le 29/03/2020 à 15:13, S L a écrit :
Folding at home

À ce sujet, il faut passer en force pour installer Fahcontrol, à cause
d'un problème de dépendances, ce qui ne l'empêche pas de fonctionner.
Mais comment faire ensuite sous Buster pour faire les mises à jour sans
le désinstaller et le réinstaller à chaque fois ? Il est considéré
comme un paquet cassé.
--
François
Fran=c3=a7ois LE GAD
Le #26541980
Le 31/03/2020 à 13:49, Guillaume Clercin a écrit :
J'ai résolu ce problème en modifiant le fichier
« /etc/apt/source.list », j'ai ajouté le dépôt de la Debian Stretch.
Ensuite, j'ai fait:
# aptitude update
# aptitude install -f
Et cela a permis d'installer les dépendances manquantes.

Merci Guillaume.
Ça m'a permis d'installer python-gnome2 qui est absent des dépôts Buster.
--
François
Fran=c3=a7ois LE GAD
Le #26541996
Le 31/03/2020 à 16:46, Guillaume Clercin a écrit :
Dans le fichier « /etc/apt/sources.list » sur un ordinateur, j'utilise
les dépôts de la stretch, buster, bullseye et sid et je n'ai pas
spécialement de difficulté à gérer les conflits.

Et il faut bien sûr avoir un fichier /etc/apt/preferences bien configuré.
--
François
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